El objetivo de este programa es fortalecer y consolidar la estructura organizativa de CONAVIGUA desde las bases comunitarias y municipales, promoviendo el liderazgo de las mujeres y garantizando su participación política y ciudadana.

La organización de CONAVIGUA, está integrada por socias en diferentes niveles; en el nivel comunitario se cuenta con una junta directiva local, en el nivel municipal con una asamblea y una junta directiva, en la asamblea nacional participan las delegadas electas en cada asamblea municipal, este nivel es donde se elige a las integrantes de la Junta Directiva Nacional. En el nivel internacional se cuenta con representación de CONAVIGUA, a través de las delegadas por la Junta Directiva Nacional, dependiendo del tema a representar.

Es en estos niveles donde las integrantes de CONAVIGUA analizan la situación de las mujeres mayas y donde se ponen en marcha los programas de CONAVIGUA para el pleno goce de los derechos individuales y colectivos de las mujeres mayas